Ad-hoc pipeline for lncRNAs identification on the genome/transcriptome of the blood fluke Schistosoma mansoni. From an article (https://www.nature.com/articles/s41598-017-10853-6) in which we have applied the computational pipelines disclosed herein (pipe-lincRNAs.pl and pipe-ASlncRNAs.pl).
The Schistosoma mansoni genome encodes thousands of long non-coding RNAs predicted to be functional at different parasite life-cycle stages
Elton J. R. Vasconcelos, Lucas F. daSilva, David S. Pires, Guilherme M. Lavezzo, Adriana S. A. Pereira, Murilo S. Amaral and Sergio Verjovski-Almeida
Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos, Instituto Butantan, 05503-900 São Paulo, SP, Brazil. Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, 05508-900 São Paulo, SP, Brazil