Bienvenidas al: Grupo de Tarea Conjunta OSINT (Open-source Intelligence) para la investigación y comunicación en torno a la pandemia de SARS-COV-2/COVID-19.
Búsqueda de información y elaboración de hipótesis. Filtro de noticias y "fake-news". Investigación ciudadana crítica. Colaboración de código libre multidisciplinar.
Evitemos distraer el hilo del grupo con noticias sensacionalistas o discusiones de opinión. Las conspiranoias y opiniones excéntricas pueden ayudar a romper la ortodoxia y el discurso dominante, pero no dejemos que el grupo derive hacia eso. La política es la gestión de los asuntos públicos por parte de los ciudadanos, pero evitemos politizar los debates en exceso y sobretodo, dentro de los paradigmas partidistas y seguidistas.
Para compartir información y opiniones en torno a teorias conspirativas tenemos el grupo específico:
http://t.me/COVID19Cowspiranoias
Salud !!
Documento colaborativo: https://paper.komun.org/p/covid19-OSINT
Dashboard Coronavirus COVID-19 (Mobile) https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/85320e2ea5424dfaaa75ae62e5c06e61
https://ciberpatrulla.com/links/
https://code.montera34.com/numeroteca/homepagex
Información verificada y de acceso público para acceder a datos acerca del virus:
https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6
https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19
https://github.com/etetoolkit/ete
https://code.montera34.com/numeroteca/covid19
Con el siguiente comando obtendriamos el plot del ejemplo .
Predice mas de 12 millones en españa de infectados, 766 mil personas muertas con la actual tasa de muerte del 6 % de los detectados, para dentro de aproximadamente 65 dias. Hay que tener en cuenta que es en caso de no tener vacuna y tratamiento, con los datos actuales extraidos de articulos y de distintas fuentes de informacion. Cada uno puede hacer sus prediccciones acorde vaya habiendo nuevos datos. Os invitamos a que encontreis un escenario que no sea horrible.
Como parametros hemos usado 8 % de tasa de recuperacion y el 6% la tasa de muertes de :
https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6
La tasa de hospitalizacion segun
24 cyclos de 7 dias (el ultimo como periodo de incubacion)
### Generate prediction
./pandemia --contact_rate 2 --infected_rate 80 --recovered 8 --hospital 25 --danger 20 --dead 6 --cycles 24 --incubation 7
### Help
./pandemia --help
The commandargs program
commandargs [OPTIONS]
Common flags:
--contact_rate=NUM Middle number of contacts
--infected_rate=NUM Number of infected vs tests realized
--recovered=NUM Recovered rate, Infected vs recovered persons
--hospital=NUM Hospitalization rate, invected vs hospitalizated
persons
--danger=NUM Danger rate, infected vs danger state infected
people
--dead=NUM Dead rate , infected vs dead people
--cycles=INT Number of incubation cycles
--incubation_days=INT Number of incubation days
--riots=INT Riots in time
--imigration_rate=INT Rate of imigrants growth
--pillage=INT Bandalism rate in shops or authority
infrastructures, cases per day
--street_police=INT Number of authority forces in the street, police
x citizens
-? --help Display help message
-V --version Print version information
Zoom con las teclas + -
Mover el espacio con el cursor
*Para windows usar el fichero pandemia.exe ejecutable.
Genomic epidemiology of novel coronavirus
https://nextstrain.org/ncov?l=clock
Users guide
https://www.ebi.ac.uk/about/vertebrate-genomics/software/exonerate-user-guide
Examples
./exonerate orf1ab2004.fasta covid
C4 Alignment:
------------
Query: AAP49011.4 orf1ab polyprotein [SARS coronavirus ZJ01]
Target: NC_045512.2 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
Model: ungapped:protein2dna
Raw score: 217
Query range: 925 -> 989
Target range: 3034 -> 3226
926 : TyrProProAspGluGluGluGluAspAspAlaGluCysGluGluGluGluIleAspGluTh : 946
!:! !||| !!:|||!!:|||!!:!!:!.!!!:|||||||||||||||.!!!!: !:!
PheTyrProProAspGluAspGluGluGluGlyAspCysGluGluGluGluPheGluProSe
3035 : TTCTACCCTCCAGATGAGGATGAAGAAGAAGGTGATTGTGAAGAAGAAGAGTTTGAGCCATC : 3095
947 : rCysGluHisGluTyrGlyThrGluAspAspTyrGlnGlyLeuProLeuGluPheGlyAlaS : 967
! !:!!:!!|||||||||||||||||||||||||||||| !||||||||||||||||||!
rThrGlnTyrGluTyrGlyThrGluAspAspTyrGlnGlyLysProLeuGluPheGlyAlaT
3096 : AACTCAATATGAGTATGGTACTGAAGATGATTACCAAGGTAAACCTTTGGAATTTGGTGCCA : 3158
968 : erAlaGluThrValArgValGluGluGluGluGluGluAspTrpLeuAspAspThrThrGlu : 987
!!:!!! .!!:!!!:! !|||||||||:!!||||||||||||||||||||| !!:!:!!
hrSerAlaAlaLeuGlnProGluGluGluGlnGluGluAspTrpLeuAspAspAspSerGln
3159 : CTTCTGCTGCTCTTCAACCTGAAGAAGAGCAAGAAGAAGATTGGTTAGATGATGATAGTCAA : 3218
988 : GlnSer : 989
|||!!!
GlnThr
3219 : CAAACT : 3226
Resumen de comparacion de proteinas originales de sars2004 , y los diferentes virus de diferentes epocas descendientes de sars2004. Resultados obtenidos con el parametro --percent de exonerate.
Proteina M 2004 , Covid 91 %
Proteina M 2004 , Batsars2020 91 %
Proteina M 2004 , Batsars2015 97 %
Proteina M 2004 , Batsars2010 98 %
Proteina Orf1ab 2004 , Covid 37 %
Proteina Orf1ab 2004 , Batsars2020 37 %
Proteina Orf1ab 2004 , Batsars2015 59 % <----- Algo extraño ya que es mas parecida a 2004 que a 2010, y 2010 muy parecido a las muestras de 2020
Proteina Orf1ab 2004 , Batsars2010 38 %
Proteina E 2004 , Covid 87 %
Proteina E 2004 , Batsars2020 87 %
Proteina E 2004 , Batsars2015 98 %
Proteina E 2004 , Batsars2010 100 %
Proteina S 2004 , Covid 42 % <------ Algo anormal en la proteina s , ha evolucionado mucho mas que su primo Batsars ? , solo en esta proteina ?
Proteina S 2004 , Batsars2020 55 %
Proteina S 2004 , Batsars2015 55 %
Proteina S 2004 , Batsars2010 56 %
Covid 19 contra Batsars2020 -> 47 % <--- Es "primo" de covid 19
Covid 19 contra Batsars2015 -> 37 %
Covid 19 contra Batsars2010 -> 34 %
Covid contra Sars -> 38 % <--- Tiene mas de 2004 que de 2010 o 2015
https://www.kaggle.com/allen-institute-for-ai/CORD-19-research-challenge/tasks
https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19
https://github.com/celiavelmar/open-covid19-test
https://world.coronavirusmakers.org/
https://gitlab.com/coronavirusmakers/recursos
En diferentes momentos del tiempo sars es reintroducido en la naturaleza, al menos alrededor de 2010 y 2013, donde un virus sin mutar vuelve a generar nuevas generaciones, Covid 19 y Batsars2020 son primos, pero ambos descienden de una especie de sars2004 no conocida. Existen escapes conocidos en la zona de Wuhan.
Es una de las teorias que plantea la revista nature.
En los archivos de la carpeta fasta estan los genomas para comprobar cada uno sus propias teorias., Tienen la referencia oficial a la fuente :
No esta claro la eficiacia en la poblacion aun de los medicamentos
- Remdesivir
- Hydroxychloroquine
Parece que ya fueron usados para el sars y solicitada patente en laboratorio de wuhan segun wikipedia
https://es.wikipedia.org/wiki/Instituto_de_Virolog%C3%ADa_de_Wuhan
- sulfato de hidroxicloroquina
- azitromicina
Se publica estudio en escasos pacientes con éxito mediante la combinación de los dos medicamentos anteriores.
https://actualidad.rt.com/actualidad/347290-anunciar-exito-pruebas-vacuna-coronavirus-francia
https://www.mediterranee-infection.com/epidemie-a-coronavirus-covid-19/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31607599
https://github.com/ecofintech/COVID-19_OSINT/tree/master/Fake_News_oficiales
La situacion actual incrementa el numero de denuncias y abusos de autoridad, desabastecimiento, desinformación, abuso de poder, manipulacion de los medios causan la crispacion de los ciudadanos, pero cual es el momento que estallan y porque.
Puede una pandemia provocar disturbios segun factores claros como, denuncias a ciudadanos en contra de derechos fundamentales, o el abuso de la fuerza por parte de la autoridad ?
Son los disturbios claramente vinculados a la presencia policial ? y el aumento de sus injustas acciones ?, el numero de multas y su concentracion en las areas de las protestas ? eso desciben en nature . (todo: añadir funciones en el simulador)
https://www.nature.com/articles/srep01303#Sec12
https://www.rtve.es/noticias/20200324/mas-102000-denuncias-932-detenidos-coronavirus/2010719.shtml
102 mil denuncias 938 arrestados
martes 24 marzo 20 mil denuncias 130 arrestados
- Un futuro donde hay vacuna antes o despues y nada de esto ha pasado y solo queda el rastro de desastres desencadenados y la conciencia social del problema de pandemia
- Leyes pandemia, leyes en nombre de la prevencion de pandemia, como siempre nos protegen de todo, datos, seguridad social , es muy probable que algun gobierno se le ocurra la idea de limitar las libertades de las persones de manera perpetua .
- Un futuro donde se receta un tratamiento para todo el mundo hasta que haya una vacuna o la poblacion se inmunice
- Un futuro en el que el control de todos los movimientos de los ciudadanos sean controlados telematicamente por ley
- Un futuro donde los controles transfronterizos o incluso entre ciudades y barrios sean posibles
EDITAR LO QUE SE OS OCURRA
......