prueba-conocimiento-adn

Este ejercicio esta desarrolado las siguientes en JAVA 11, con Springboot 2.6.7. usando una base de datos de PostgreSql. Expondiendo un servicio web para determinar si un

Funcionamiento

Esta aplicacion esta diseñada para exponer un servicio web, que detecte si una persona tiene diferencias genéticas basándose en su secuencia de ADN.

El servicio debe de recibir como parámetro un arreglo de Strings que representan cada fila de una matriz (de NxN) con la secuencia del ADN. Las letras de los Strings solo pueden ser: (A,T,C,G), las cuales representan cada base nitrogenada del ADN.

Sin mutación: A T G C G A
C A G T G C
T T A T T T
A G A C G G
G C G T C A
T C A C T G

Con mutación: A T G C G A
C A G T G C
T T A T G T
A G A A G G
C C C C T A
T C A C T G

Se sabe que existe una mutación si se encuentra más de una secuencia de cuatro letras iguales, de forma oblicua, horizontal o vertical.

Requerimientos

• Java 11
• Maven 3.6.0
• PostgreSql

Instalación

1. Clona este repositorio

git clone https://github.com/boghus/prueba-conocimiento-adn.git

2. Crea la base de datos Postgresql

create database dbprueba_adn; 

3. Configura tu usuario y contraseña para la base de datos

• Edita el archivo src/main/resources/application.properties
• Introduce los valores de spring.datasource.username y spring.datasource.password con los datos de tu usuario de base de datos PostgreSql

4. Ejecuta la aplicación

Ejecutar el proyecto con java -jar

mvn package
java -jar -Dspring.profiles.active=test target/com.sprinboot.adn-0.0.1-SNAPSHOT.war

Como alternativa se puede ejecutar la aplicacion sin empaquetar usando:

mvn spring-boot:run 

La aplicacion debera ejecutarse en la siguiente dirección http://localhost:8080.

API

POST mutation

Identifica si el arreglo de Strings contiene mutación

Metodo	POST
URL	"mutation/index", "mutation"
Entrada	JSON con la estructura dna, y la lista de Strings. Ejemplo {"dna":["ATGCGA","CAGTGC","TTATGT","AGAAGG","CCCCTA","TCACTG"]}
Salida	Si tiene mutación se regresa un codigo 200, si no existe mutacion 403
curl	curl --request POST --url http://localhost:8080/mutation/index --header 'Content-Type: application/json' --data '{ "dna":["ATGCGA","CAGTGC","TTATGT","AGAAGG","CCCCTA","TCACTG"] }'

Get mutation/status

Indica las estadisticas de los mutaciones revisadas

Metodo	Get
URL	"mutation/status"
Salida	Regresa un json con los siguientes parametros, count_mutation: indica la cantidad de pruebas totales que ha tenido mutacion, count_no_mutaions: indica la cantidad de pruebas totales que NO ha tenido mutacion, ratio: la relacion entre estos dos valores
curl	curl --request GET --url http://localhost:8080/mutation/status }'