Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

PD and PF (without SMOTE) #5

Open
rahlk opened this issue Nov 4, 2016 · 0 comments
Open

PD and PF (without SMOTE) #5

rahlk opened this issue Nov 4, 2016 · 0 comments

Comments

@rahlk
Copy link
Owner

rahlk commented Nov 4, 2016

FALSE ALARMS

  • Still too high without SMOTE
  • This was done using Scikit Learn's Random Forest
  • Next: Same with Logistic Regression from Weka (as per HDP paper)
/Users/rkrsn/git/rahlk/Bellwether/src/SEER/pickles/pretty_print.py

## JDT

name 	 Pd 	 Pf 	 G
log4 	 0.94 	 0.77 	 0.85
xala 	 0.81 	 0.86 	 0.83
xerc 	 0.82 	 0.69 	 0.75
luce 	 0.82 	 0.50 	 0.62
velo* 	 0.72 	 0.45 	 0.56
poi 	 0.56 	 0.10 	 0.17
came 	 0.47 	 0.09 	 0.16
ivy 	 0.08 	 0.01 	 0.02
ant 	 0.12 	 0.00 	 0.01
jedi 	 0.01 	 0.00 	 0.00
## PDE

name 	 Pd 	 Pf 	 G
luce 	 0.93 	 0.89 	 0.91
velo 	 0.82 	 0.91 	 0.86
log4 	 0.87 	 0.64 	 0.74
poi 	 0.78 	 0.63 	 0.70
xala 	 0.80 	 0.58 	 0.67
xerc 	 0.38 	 0.16 	 0.22
ivy 	 0.06 	 0.03 	 0.04
came 	 0.03 	 0.01 	 0.01
ant 	 0.00 	 0.00 	 0.00
jedi 	 0.00 	 0.00 	 0.00
## EQ

name 	 Pd 	 Pf 	 G
velo 	 0.88 	 0.95 	 0.92
xerc 	 0.56 	 0.67 	 0.61
xala* 	 0.74 	 0.45 	 0.56
log4* 	 0.84 	 0.32 	 0.46
luce* 	 0.69 	 0.28 	 0.40
poi* 	 0.63 	 0.22 	 0.32
came 	 0.42 	 0.15 	 0.22
ivy 	 0.16 	 0.06 	 0.09
jedi 	 0.12 	 0.01 	 0.02
ant 	 0.07 	 0.01 	 0.01
## LC

name 	 Pd 	 Pf 	 G
luce 	 1.00 	 0.87 	 0.93
log4 	 0.92 	 0.84 	 0.88
velo 	 0.88 	 0.77 	 0.82
xerc 	 0.84 	 0.79 	 0.81
xala 	 0.89 	 0.50 	 0.64
came 	 0.53 	 0.49 	 0.51
poi 	 0.42 	 0.09 	 0.15
ivy 	 0.03 	 0.03 	 0.03
jedi 	 0.03 	 0.01 	 0.01
ant 	 0.03 	 0.00 	 0.00
## ML

name 	 Pd 	 Pf 	 G
xala 	 0.77 	 0.52 	 0.62
log4 	 0.63 	 0.55 	 0.59
velo 	 0.47 	 0.31 	 0.38
luce 	 0.45 	 0.20 	 0.28
xerc 	 0.18 	 0.34 	 0.23
poi 	 0.18 	 0.10 	 0.13
ivy 	 0.11 	 0.04 	 0.05
jedi 	 0.13 	 0.02 	 0.04
ant 	 0.07 	 0.02 	 0.03
came 	 0.04 	 0.02 	 0.03
## Apache

name 	 Pd 	 Pf 	 G
LC  	 0.41 	 0.19 	 0.26
EQ  	 0.33 	 0.20 	 0.25
JDT 	 0.44 	 0.17 	 0.24
ML  	 0.51 	 0.15 	 0.23
PDE 	 0.06 	 0.04 	 0.05
## Safe

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.86 	 0.68 	 0.76
PDE* 	 0.64 	 0.44 	 0.52
LC * 	 0.73 	 0.35 	 0.48
JDT* 	 0.77 	 0.32 	 0.46
ML  	 0.55 	 0.12 	 0.19
## Zxing

name 	 Pd 	 Pf 	 G
JDT* 	 0.62 	 0.39 	 0.48
EQ * 	 0.60 	 0.39 	 0.47
PDE 	 0.50 	 0.38 	 0.43
ML  	 0.31 	 0.23 	 0.27
LC  	 0.36 	 0.20 	 0.26
## Apache

name 	 Pd 	 Pf 	 G
luce 	 0.91 	 0.65 	 0.75
log4 	 0.83 	 0.55 	 0.66
xala 	 0.68 	 0.53 	 0.60
xerc* 	 0.78 	 0.46 	 0.58
poi* 	 0.80 	 0.38 	 0.51
came* 	 0.81 	 0.34 	 0.48
velo 	 0.36 	 0.51 	 0.42
ivy 	 0.57 	 0.24 	 0.34
jedi 	 0.13 	 0.02 	 0.04
ant 	 0.04 	 0.01 	 0.02
## Safe

name 	 Pd 	 Pf 	 G
xala 	 0.91 	 0.82 	 0.86
luce 	 0.86 	 0.62 	 0.72
xerc 	 0.86 	 0.56 	 0.68
poi 	 0.82 	 0.56 	 0.66
velo 	 0.59 	 0.68 	 0.63
came* 	 0.77 	 0.41 	 0.54
log4* 	 0.82 	 0.38 	 0.52
jedi* 	 0.64 	 0.35 	 0.45
ivy* 	 0.68 	 0.24 	 0.35
ant* 	 0.64 	 0.24 	 0.34
## Zxing

name 	 Pd 	 Pf 	 G
velo 	 0.99 	 0.90 	 0.94
log4 	 0.81 	 0.79 	 0.80
xala 	 0.86 	 0.72 	 0.78
poi 	 0.81 	 0.66 	 0.73
luce 	 0.77 	 0.51 	 0.62
xerc 	 0.64 	 0.59 	 0.61
came* 	 0.67 	 0.41 	 0.51
ivy 	 0.34 	 0.16 	 0.22
ant 	 0.11 	 0.04 	 0.06
jedi 	 0.02 	 0.01 	 0.01
## Apache

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm * 	 0.67 	 0.39 	 0.49
mc  	 0.14 	 0.24 	 0.18
cm  	 0.42 	 0.10 	 0.17
kc  	 0.07 	 0.05 	 0.06
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## Safe

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm * 	 0.86 	 0.35 	 0.50
mc  	 0.32 	 0.15 	 0.20
kc  	 0.00 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.14 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.05 	 0.00 	 0.00
## Zxing

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.58 	 0.38 	 0.46
cm  	 0.08 	 0.07 	 0.08
mc  	 0.02 	 0.08 	 0.03
kc  	 0.02 	 0.06 	 0.03
mw  	 0.01 	 0.00 	 0.01
## JDT

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.75 	 0.66 	 0.70
kc  	 0.20 	 0.04 	 0.07
mc  	 0.21 	 0.02 	 0.04
cm  	 0.02 	 0.01 	 0.01
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## PDE

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.43 	 0.32 	 0.37
kc  	 0.06 	 0.03 	 0.04
mc  	 0.10 	 0.01 	 0.02
cm  	 0.00 	 0.01 	 0.01
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## EQ

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm * 	 0.69 	 0.37 	 0.48
kc  	 0.48 	 0.15 	 0.23
cm  	 0.04 	 0.01 	 0.01
mc  	 0.01 	 0.01 	 0.01
mw  	 0.02 	 0.00 	 0.00
## LC

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm * 	 0.73 	 0.39 	 0.51
mc  	 0.03 	 0.03 	 0.03
kc  	 0.05 	 0.01 	 0.01
mw  	 0.02 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## ML

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.20 	 0.10 	 0.13
cm  	 0.02 	 0.01 	 0.01
kc  	 0.01 	 0.00 	 0.00
mc  	 0.02 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## JDT

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.36 	 0.20 	 0.26
Apac 	 0.07 	 0.02 	 0.03
Zxin 	 0.10 	 0.01 	 0.01
## PDE

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.47 	 0.30 	 0.37
Apac 	 0.29 	 0.14 	 0.19
Zxin 	 0.03 	 0.01 	 0.01
## EQ

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.16 	 0.18 	 0.17
Safe 	 0.21 	 0.04 	 0.06
Zxin 	 0.07 	 0.04 	 0.05
## LC

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.34 	 0.16 	 0.22
Zxin 	 0.08 	 0.02 	 0.04
Safe 	 0.08 	 0.02 	 0.03
## ML

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.25 	 0.18 	 0.21
Zxin 	 0.27 	 0.17 	 0.21
Apac 	 0.06 	 0.04 	 0.05
## ant

name 	 Pd 	 Pf 	 G
LC * 	 0.67 	 0.22 	 0.33
EQ  	 0.54 	 0.22 	 0.32
PDE 	 0.21 	 0.37 	 0.27
JDT 	 0.32 	 0.08 	 0.13
ML  	 0.09 	 0.01 	 0.02
## xerces

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.67 	 0.74 	 0.71
LC  	 0.22 	 0.10 	 0.14
JDT 	 0.13 	 0.10 	 0.11
EQ  	 0.12 	 0.07 	 0.09
ML  	 0.04 	 0.03 	 0.04
## xalan

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.70 	 0.67 	 0.69
JDT 	 0.73 	 0.57 	 0.64
EQ  	 0.55 	 0.49 	 0.52
LC  	 0.25 	 0.09 	 0.13
ML  	 0.04 	 0.01 	 0.02
## camel

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.57 	 0.42 	 0.48
PDE 	 0.27 	 0.20 	 0.23
ML  	 0.10 	 0.06 	 0.07
LC  	 0.13 	 0.04 	 0.06
JDT 	 0.05 	 0.01 	 0.01
## log4j

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ * 	 0.62 	 0.48 	 0.54
LC  	 0.50 	 0.22 	 0.31
PDE 	 0.13 	 0.15 	 0.14
JDT 	 0.25 	 0.10 	 0.14
ML  	 0.02 	 0.00 	 0.00
## lucene

name 	 Pd 	 Pf 	 G
JDT 	 0.40 	 0.14 	 0.20
PDE 	 0.13 	 0.20 	 0.16
LC  	 0.18 	 0.05 	 0.08
EQ  	 0.17 	 0.05 	 0.08
ML  	 0.08 	 0.03 	 0.05
## jedit

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.60 	 0.34 	 0.43
JDT 	 0.53 	 0.17 	 0.25
PDE 	 0.24 	 0.13 	 0.17
ML  	 0.17 	 0.11 	 0.13
LC  	 0.33 	 0.08 	 0.13
## poi

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.21 	 0.25 	 0.23
EQ  	 0.14 	 0.15 	 0.15
JDT 	 0.06 	 0.03 	 0.04
ML  	 0.06 	 0.02 	 0.03
LC  	 0.02 	 0.01 	 0.01
## velocity

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.49 	 0.41 	 0.45
PDE 	 0.14 	 0.16 	 0.15
ML  	 0.11 	 0.09 	 0.10
JDT 	 0.14 	 0.07 	 0.09
LC  	 0.07 	 0.05 	 0.06
## ivy

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.93 	 0.73 	 0.82
PDE 	 0.29 	 0.43 	 0.34
LC  	 0.42 	 0.15 	 0.23
ML  	 0.11 	 0.04 	 0.06
JDT 	 0.18 	 0.03 	 0.05
## ant

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm * 	 0.66 	 0.30 	 0.41
kc  	 0.44 	 0.18 	 0.26
mc  	 0.09 	 0.02 	 0.04
mw  	 0.02 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## xerces

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.62 	 0.52 	 0.57
kc  	 0.18 	 0.15 	 0.16
mc  	 0.08 	 0.04 	 0.05
cm  	 0.02 	 0.00 	 0.01
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## xalan

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.33 	 0.24 	 0.28
mc  	 0.02 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.01 	 0.00 	 0.00
kc  	 0.00 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## camel

name 	 Pd 	 Pf 	 G
kc  	 0.31 	 0.23 	 0.27
jm  	 0.30 	 0.19 	 0.23
cm  	 0.02 	 0.01 	 0.01
mc  	 0.01 	 0.00 	 0.01
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## log4j

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.50 	 0.33 	 0.40
mc  	 0.11 	 0.04 	 0.06
cm  	 0.09 	 0.03 	 0.05
mw  	 0.05 	 0.04 	 0.04
kc  	 0.07 	 0.01 	 0.02
## lucene

name 	 Pd 	 Pf 	 G
mc  	 0.19 	 0.15 	 0.17
jm  	 0.21 	 0.07 	 0.11
kc  	 0.02 	 0.01 	 0.01
cm  	 0.01 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## jedit

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.47 	 0.14 	 0.22
kc  	 0.02 	 0.01 	 0.01
cm  	 0.04 	 0.01 	 0.01
mc  	 0.02 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## poi

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.37 	 0.20 	 0.26
mc  	 0.12 	 0.06 	 0.08
kc  	 0.08 	 0.02 	 0.03
mw  	 0.01 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.01 	 0.00 	 0.00
## velocity

name 	 Pd 	 Pf 	 G
jm  	 0.49 	 0.35 	 0.41
mc  	 0.45 	 0.36 	 0.40
kc  	 0.32 	 0.19 	 0.24
mw  	 0.01 	 0.00 	 0.00
cm  	 0.00 	 0.00 	 0.00
## ivy

name 	 Pd 	 Pf 	 G
kc  	 0.42 	 0.34 	 0.38
mc  	 0.42 	 0.28 	 0.33
jm  	 0.39 	 0.17 	 0.24
cm  	 0.03 	 0.00 	 0.00
mw  	 0.01 	 0.00 	 0.00
## ant

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.49 	 0.26 	 0.34
Zxin 	 0.24 	 0.37 	 0.29
Apac 	 0.01 	 0.01 	 0.01
## xerces

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.38 	 0.38 	 0.38
Zxin 	 0.33 	 0.29 	 0.31
Apac 	 0.17 	 0.11 	 0.14
## xalan

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.22 	 0.20 	 0.21
Zxin 	 0.21 	 0.20 	 0.21
Safe 	 0.13 	 0.06 	 0.08
## camel

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.30 	 0.29 	 0.29
Zxin 	 0.06 	 0.07 	 0.07
Safe 	 0.02 	 0.01 	 0.01
## log4j

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Zxin 	 0.08 	 0.07 	 0.08
Apac 	 0.04 	 0.10 	 0.06
Safe 	 0.02 	 0.01 	 0.01
## lucene

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Zxin 	 0.22 	 0.09 	 0.13
Apac 	 0.03 	 0.01 	 0.02
Safe 	 0.04 	 0.00 	 0.00
## jedit

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.36 	 0.15 	 0.21
Safe 	 0.02 	 0.01 	 0.01
Zxin 	 0.00 	 0.00 	 0.00
## poi

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Zxin 	 0.12 	 0.12 	 0.12
Apac 	 0.11 	 0.04 	 0.06
Safe 	 0.04 	 0.07 	 0.05
## velocity

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.23 	 0.17 	 0.19
Apac 	 0.13 	 0.08 	 0.10
Zxin 	 0.01 	 0.01 	 0.01
## ivy

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.13 	 0.09 	 0.10
Safe 	 0.13 	 0.07 	 0.10
Zxin 	 0.09 	 0.06 	 0.08
## kc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.78 	 0.66 	 0.72
JDT 	 0.56 	 0.39 	 0.46
LC  	 0.56 	 0.24 	 0.33
PDE 	 0.42 	 0.18 	 0.25
ML  	 0.06 	 0.01 	 0.02
## jm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.04 	 0.02 	 0.03
EQ  	 0.03 	 0.00 	 0.01
ML  	 0.01 	 0.00 	 0.01
LC  	 0.01 	 0.00 	 0.00
JDT 	 0.01 	 0.00 	 0.00
## mw

name 	 Pd 	 Pf 	 G
EQ  	 0.96 	 0.89 	 0.92
JDT 	 0.89 	 0.68 	 0.77
PDE* 	 0.67 	 0.44 	 0.53
LC * 	 0.70 	 0.37 	 0.49
ML  	 0.59 	 0.24 	 0.35
## cm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.79 	 0.65 	 0.71
JDT 	 0.36 	 0.18 	 0.24
LC  	 0.31 	 0.13 	 0.19
EQ  	 0.33 	 0.10 	 0.15
ML  	 0.21 	 0.07 	 0.10
## mc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
PDE 	 0.75 	 0.75 	 0.75
JDT 	 0.78 	 0.60 	 0.68
EQ  	 0.58 	 0.41 	 0.48
LC * 	 0.61 	 0.29 	 0.40
ML  	 0.53 	 0.29 	 0.38
## kc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
velo 	 0.97 	 0.97 	 0.97
came 	 1.00 	 0.84 	 0.91
log4 	 0.97 	 0.84 	 0.90
xala 	 0.89 	 0.73 	 0.80
luce 	 0.86 	 0.69 	 0.77
xerc 	 0.78 	 0.71 	 0.74
poi 	 0.67 	 0.58 	 0.62
jedi 	 0.31 	 0.14 	 0.20
ivy 	 0.33 	 0.11 	 0.17
ant 	 0.19 	 0.14 	 0.16
## jm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
velo 	 0.84 	 0.68 	 0.75
came* 	 0.71 	 0.48 	 0.57
xerc 	 0.43 	 0.62 	 0.51
log4 	 0.36 	 0.32 	 0.34
poi 	 0.47 	 0.25 	 0.32
luce 	 0.37 	 0.16 	 0.22
xala 	 0.23 	 0.17 	 0.19
ivy 	 0.00 	 0.00 	 0.00
ant 	 0.00 	 0.00 	 0.00
jedi 	 0.00 	 0.00 	 0.00
## mw

name 	 Pd 	 Pf 	 G
log4 	 1.00 	 0.97 	 0.98
velo 	 0.96 	 0.94 	 0.95
poi 	 1.00 	 0.90 	 0.94
luce 	 0.89 	 0.85 	 0.87
came 	 0.89 	 0.81 	 0.85
xerc 	 0.89 	 0.70 	 0.79
xala 	 0.85 	 0.67 	 0.75
ant* 	 0.74 	 0.34 	 0.46
jedi 	 0.41 	 0.41 	 0.41
ivy 	 0.44 	 0.19 	 0.27
## cm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
log4 	 0.95 	 0.87 	 0.91
xala 	 0.93 	 0.81 	 0.86
velo 	 0.93 	 0.73 	 0.82
poi 	 0.86 	 0.63 	 0.73
luce* 	 0.81 	 0.42 	 0.55
xerc* 	 0.64 	 0.42 	 0.51
came 	 0.45 	 0.16 	 0.23
jedi 	 0.14 	 0.05 	 0.08
ant 	 0.07 	 0.03 	 0.05
ivy 	 0.10 	 0.03 	 0.04
## mc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
log4 	 0.97 	 0.91 	 0.94
poi 	 0.97 	 0.90 	 0.93
luce 	 0.89 	 0.74 	 0.81
velo 	 0.78 	 0.83 	 0.80
xala 	 0.89 	 0.66 	 0.76
xerc 	 0.78 	 0.60 	 0.67
came 	 0.56 	 0.37 	 0.44
ivy 	 0.39 	 0.15 	 0.22
ant 	 0.11 	 0.04 	 0.06
jedi 	 0.17 	 0.03 	 0.04
## kc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.47 	 0.31 	 0.38
Zxin 	 0.36 	 0.37 	 0.37
Safe 	 0.42 	 0.22 	 0.29
## jm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Apac 	 0.02 	 0.00 	 0.00
Zxin 	 0.00 	 0.00 	 0.00
Safe 	 0.01 	 0.00 	 0.00
## mw

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.52 	 0.30 	 0.38
Apac 	 0.04 	 0.09 	 0.05
Zxin 	 0.00 	 0.00 	 0.00
## cm

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Zxin 	 0.29 	 0.19 	 0.23
Safe 	 0.07 	 0.06 	 0.06
Apac 	 0.10 	 0.04 	 0.05
## mc

name 	 Pd 	 Pf 	 G
Safe 	 0.36 	 0.16 	 0.22
Zxin 	 0.03 	 0.11 	 0.04
Apac 	 0.08 	 0.01 	 0.01

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant