30_Biological_Data.Rmd

# Datos biológicos

## Taxonomía

El Registro de Especies Marinas Antárticas (RAMS) es la base de datos taxonómica autorizada para organismos marinos antárticos. RAMS forma parte del Registro Mundial de Especies Marinas (WoRMS).

- [`worrms`](https://cran.r-project.org/package=worrms) es un cliente API [WoRMS](http://www.marinespecies.org/). Contiene principalmente datos taxonómicos,  pero también datos de rasgos.
- [`taxize`](https://cran.r-project.org/package=taxize) proporciona acceso a alrededor de 20 fuentes de datos taxonómicos, incluido WoRMS. Tiene salidas de datos coherentes e interfaces de funciones consistentes en las diferentes fuentes de datos taxonómicos, para que no necesites adaptar tu código a diferentes proveedores de datos taxonómicos.

Actualmente, RAMS se está ampliando para cubrir taxones no marinos, que se convertirán en el Registro de Especies Antárticas (RAS). Esperamos que esto siga siendo compatible con `worrms` y la infraestructura en el servidor alojada por VLIZ.

Para obtener más detalles sobre paquetes de `R` relacionados con la taxonomía en general, consulta la [vista de tareas de taxonomía de rOpenSci](https://github.com/ropensci/taxonomy).

## Otros paquetes

El seguimiento de animales mediante etiquetas de satélite, GPS o geolocalización a nivel de luz es común, y existen muchos paquetes de `R` que pueden ayudar con esto. Consulta la [vista de tareas espacio-temporales](https://cloud.r-project.org/web/views/SpatioTemporal.html) para obtener una lista más completa. También pueden resultar de interés:

- [`TwilightFree`](https://github.com/ABindoff/TwilightFree) proporciona un método para procesar datos de geolocalización a nivel de luz que es robusto ante el ruido (sombreado y ocultación del sensor) y puede ser especialmente adecuado para aplicaciones en el Océano Austral.

- [`traipse`](https://github.com/Trackage/traipse) proporciona herramientas para datos de seguimiento, para métricas comunes de distancia, dirección, y velocidad.

- [`foieGras`](https://github.com/ianjonsen/foieGras) ajusta un modelo de tiempo continuo (RW o CRW) en forma de espacio-estado para filtrar datos de ubicación satelital de Argos.